Les premiers colons se sont installés à McWatters vers 1930. C'est un prospecteur, monsieur Dave McWatters, qui est à l'origine de l'appellation de la municipalité; Monsieur McWatters a également fondé la McWatters Gold Mines, en exploitation de 1932 à 1944. La localité a cependant été formée en 1938. En 1938, la Compagnie internationale de papier (C.I.P.) construit un grand dépôt forestier le long de la rivière Kinojévis, qui coule non loin de la localité. Le Dépôt-McWatters devient au cours des années le centre d'approvisionnement de tous les chantiers de la filiale Kipawa-Noranda de la C.I.P. Les remorqueurs, qui tirent sur la rivière Kinojévis le bois acheté aux ruraux de la région de Rouyn, y sont rattachés. Depuis 1979, le territoire constitue une municipalité autonome. À l'origine, McWatters était constituée de trois noyaux à la fois distincts et distants: McWatters (autrefois Kinojévis), Farmborough et Joannes, ce qui explique en partie l'étalement de la population