Le Fonds Jean-Claude Deschênes illustre surtout le bourgeonnement de la sécularisation des structures hospitalières au Québec durant une période allant de la fin des années quarante au début des années soixante. Les documents témoignent, par conséquent, de la lutte de pouvoir interne par les choix politiques à faire face à la montée de la présence de l'État et à l'augmentation de l'influence des laïcs au sein du système de santé québécois durant l'ère duplessiste et le début de la Révolution tranquille. Ils témoignent également du travail de communication de M. Deschênes dans le domaine de la santé et de la gestion du personnel cadre de l'appareil gouvernemental québécois. Parmi les documents qui composent ce fonds, signalons des articles tirés des revues l'HÔPITAL D'AUJOURD'HUI, LE GUIDE HOSPITALIER, ainsi qu'une bibliographie rétrospective de l'HÔPITAL D'AUJOURD'HUI (1955-1966) et un mémoire sur les problèmes hospitaliers présenté par le comité hospitalier du Québec en 1954. Nous retrouvons également les écrits de M. Deschênes sous forme de publications, d'études, de rapports, d'articles publiés dans l'HÔPITAL D'AUJOURD'HUI, l'AVENIR et différents journaux, une liste de ses conférences écrites ainsi que des entrevues publiées. Le fonds comporte également six vidéos concernant, entre autres, le développement des ressources humaines, la motivation au travail, la gestion de l'État, les primes de rendement dans la fonction publique, l'ÉNAP et la formation du personnel cadre ainsi que l'éthique dans la fonction publique. Cinq bandes magnétiques traitent de l'évolution du réseau des affaires sociales, de la gestion de l'administration publique et de la réforme de la Santé de Marc-Yvan Côté. Les vidéos et les bandes magnétiques sont des entrevues ou des conférences données par M. Deschênes dans les années 1980, 1990 et 2000