Le fonds est constitué de documents divers. Les documents témoignent des deux orientations professionnelles de Michèle Cournoyer, soit son activité en arts visuels et son travail de cinéaste. Il s'agit dans la majorité des cas de dessins originaux formant les scénarimages (story board). S'y ajoutent les portraits de deux cinéastes (Jacques Drouin et Hubert-Yves Rose) ainsi qu'un projet d'affiche pour "Sonatine", le livre d'art de "Spaghettata" et treize grands dessins préliminaires du film "Dolorosa", excellent exemple de l'utilisation de la rotoscopie comme technique intermédiaire pour l'analyse du mouvement en animation. Les documents relatifs à son travail de cinéaste concernent les films qu'elle a réalisé de façon indépendante de 1970 à 1988, ainsi que des films jamais réalisés ou en projet.