Le fonds d’archives témoigne de l’itinéraire d’un scientifique, depuis ses études de 2e cycle en 1974 et jusqu’à son insertion dans la carrière universitaire à la fin des années 80. De ses études supérieures et de ses projets de recherche, le fonds d’archives contient une importante documentation taxonomique, iconographique et méthodologique, des résultats des analyses appliquées aux sédiments quaternaires lacustres, marins et aux tourbes en contexte québécois. Par ses travaux, il a été amené à établir les fondements de l'analyse des diatomées, la rendant accessible enfin à plusieurs chercheurs œuvrant au Québec et au Canada. Ses recherches sur les diatomées l’ont mené dans différentes régions du Québec. Les nombreux relevés effectués par le scientifique, que l’on retrouve dans les archives, concernent principalement le Bas-Saint-Laurent, la Gaspésie, le Nord-du-Québec et dans une moindre mesure le Saguenay et la région de Québec. Pendant ses années d’études, il fréquente les grands antiquariats européens afin de se doter des grands ouvrages indispensables à l’identification des diatomées, ces algues microscopiques de silice. Dessins et photos révèlent les subtiles différences entre ces élégantes silhouettes. Guy Lortie a réuni, venant de toute l’Europe, de Russie, du Japon et bien d’autres pays, les grands inventaires anciens ou plus récents qui constituent des classiques de la discipline dont plusieurs relèvent du livre rare. Reconnu comme géologue et diatomiste, il fut le seul spécialiste québécois de l'étude des diatomées appliquée aux recherches sur le Quaternaire. Encore aujourd'hui, dans un terrain sur lequel ont œuvré et œuvrent toujours de nombreux chercheurs, les données qu'il a accumulées et les interprétations qu'il a proposées restent valables. Le fonds réunit les manuscrits de ses nombreuses publications dans des revues scientifiques et des ouvrages écrits en collaboration. Nous y retrouvons, de plus, des manuscrits et des notes préparées pour des conférences présentées au Québec, au Canada et ailleurs dans le monde scientifique. Surtout, le fonds d’archives réunit l’ensemble des projets réalisés par Guy Lortie et ceux inachevés à la suite de son décès. Le fonds contient les dossiers d’identification des diatomées : classeurs regroupant les photographies; les lames de référence; les relevés de terrain; les feuilles de comptage, etc. Il contient également les dossiers de ces projets : carnets de relevés, comptages, notes, cartes topographiques et géologiques manuscrites, photos aériennes
